Monitoring krajských RIS3 strategií je v kompetenci jednotlivých regionů. Kraje pro potřeby národní úrovně vyplňují krajské karty, ve kterých jsou zachyceny aktivity VaVaI v jednotlivých krajích – P2 Krajské karty, které mimo jiné zahrnují i krajské domény specializace pro jednotlivé kraje.
Na národní úrovni RIS3 strategie jsou monitorovány krajské domény specializace pouze u programů zaměřených na podporu znevýhodněných a postižených regionů ČR.
